神秘船票是前往特殊岛屿的关键道具，主要用于解锁后期剧情和捕捉稀有精灵。获取该道具的核心流程涉及完成特定主线任务并触发隐藏剧情，具体需要先帮助正辉博士解决变身问题。
正辉博士位于华蓝市右侧25号道路尽头的独立房屋内。进入后会遇到一只皮皮，与之对话发现它其实是正辉博士因实验失败变成的形态。通过操作屋内电脑帮助其恢复人形后，作为感谢，他会将神秘船票赠予玩家。需该剧情需在击败华蓝市道馆馆主小霞并完成圣安奴号游轮事件后才能触发。
圣安奴号游轮事件是获取船票的前置条件。玩家需持有从正辉博士处获得的普通船票，在枯叶市码头登船。游轮内部需击败包括劲敌小茂在内的多名训练师，最后在船长室帮助晕船的船长按摩背部，获得秘传机居合斩。完成该事件后返回正辉博士处，才能推进后续剧情。
神秘船票的使用需结合游戏后期解锁的七岛剧情。通关联盟后，玩家需在一号岛的宝可梦中心与研究员对话升级图鉴，之后才能凭船票乘船前往诞生岛等特殊区域。这些岛屿分布着幻之宝可梦如代欧奇希斯，且地形多为复杂迷宫，建议提前准备会冲浪、怪力等技能的宝可梦。
整个获取流程强调主线任务的连贯性，若未按顺序触发关键节点可能导致剧情卡顿。建议在完成华蓝市剧情后优先处理正辉博士支线，避免遗漏重要道具。游轮和特殊岛屿的训练师等级较高，需提前提升队伍实力以确保顺利探索。
