武器和功夫系统是游戏的核心玩法之一，其设计不仅融合了传统武侠元素，还加入了独特的创新机制。游戏中的武器种类繁多，包括剑、刀、枪、棍等传统兵器，但更引人注目的是那些稀有且功能特殊的装备，如金甲圣衣。金甲圣衣作为60级金色品质及以上装备，穿戴后可显著提升角色属性，当穿戴件数达到1、3、5、8、11件时，还能获得额外金币奖励。这种装备的获取方式多样，包括副本掉落、藏宝图挖取以及帮会活动，玩家需要通过合理规划和资源投入才能逐步集齐。
功夫系统在卧虎藏龙二中同样丰富，不同职业拥有独特的技能树和战斗风格。巨剑职业以多段控制和伤害兼修著称，其技能设计注重实战中的灵活性和爆发力。玩家可以通过技能加点、内功修炼和武学领悟来进一步提升角色的战斗力。内功系统尤其重要，选择与角色属性匹配的内功路径，能够解锁特殊效果，如增加暴击率或降低受到的伤害。游戏中的轻功系统不仅用于移动，还能在战斗中发挥关键作用，如躲避技能或快速接近敌人。
装备的强化和洗练是提升战力的重要途径。玩家可以通过消耗洗练石、银两等材料对装备进行洗练，以提升基础属性或解锁隐藏特效。高级装备的洗练效果更为显著，但低级装备同样可以通过洗练获得可观的性能提升。洗练过程中，玩家需关注特殊效果的解锁情况，如增加暴击率或降低受到的伤害，这些效果能大幅提升角色的战斗力。若对洗练结果不满意，可多次尝试，但需注意资源消耗。装备强化能直接提升装备的基础属性，是玩家在游戏初期就能开始使用的战力提升手段。
游戏的武器和功夫系统还融入了策略性玩法。劫镖任务不仅考验玩家的战斗能力，还需合理搭配技能和装备以应对不同敌人。跨服国战和帮会争霸赛等大型活动则要求玩家在团队协作中发挥各自的武器和功夫优势。游戏中的奇遇任务和隐藏剧情也可能为玩家提供独特的武器或功夫秘籍，进一步丰富游戏体验。通过不断探索和优化装备与技能组合，玩家可以在江湖中逐步成长为顶尖高手。
